进化论在达尔文之后还经历了两次革命性变化，用硬核内容的新纲领取代了旧纲领，某些思维方式类似，但是阐述的内容有很大差别。
第一次是孟德尔革命，孟德尔（Gregor Johann Mendel）把基因概念和孟德尔定律加入了进化论。
第二次革命是汉密尔顿-史密斯革命，威廉·唐纳德·汉密尔顿（William Donald Hamilton）为进化论引入了汉密尔顿法则，该法则通俗的说就是，选择的单位是基因而非个体，即，计算遗传收益的单位是基因传播率，而非个体繁殖率。 约翰·梅纳德·史密斯（John Maynard Smith）也独立获得了这一思想（虽然最初并未显明表达），并且用博弈论重建了进化理论的数学基础，其核心便是“进化策略均衡”（evolutionary stable strategy）
追随汉密尔顿-史密斯纲领的学者被称为新达尔文主义者（neo-Darwinists），他们以此纲领为基础把革命广泛扩展到动物行为学、人类行为学、社会生物学、认知心理学等多个学科，这场革命带来的冲击波远未平息，它注定要影响这些学科未来几十年的发展方向。
自私把基因拟人化了，但是基因实际上是无目的、无意识的，它只是在某种物理法则下想尽可能地复制。
个体可以看成是基因用以复制基因的载体，完成目的之后就可以被抛弃。这种观点颠覆了那种认为演化将带来一个更和谐、稳定、健康的世界的传统信念。我们都希望生活得健康快乐，但是自然选择却一点也不关心我们是否快乐。
博弈论（Game Theory）中有一个概念，叫做ESS（Evolutionarily Stable Strategy），中文可以翻译为进化上的稳定策略。
在一个种群中，对于个体来讲，最好的行为策略取决于种群的大多数成员在做什么。其实就是三个字——随大流。一种ESS一旦确立，就会稳定下来。偏离ESS的行为将要受到自然选择的惩罚。
例子：两性相处
雌性两种策略分为羞怯（coy）和放荡（fast）； 雄性两种策略分为忠诚（faithful）和薄情（philanderer）， 四种策略的行为准则：